Adı Şrek olan yeşil bir dev, Lord Farquaad ile içinden çıkılmaz bir çatışma içerisindedir. Şrek, bataklığını Lord'dan geri istemeye kararlıdır ve bu yüzden yanına gürültü yapmayı çok seven bir eşeği de alarak yola koyulur. Ancak istediği şey yerine bir anlaşma yapmak zorunda kalır. Farquaad kral olmak istiyordur ve bunun için de Şrek'i bir göreve yollar. Şrek'in görevi bir ejderha tarafından muhafaza edilen bir kaledeki güzel prenses Fiona'yı kurtarmaktır. Şrek, Fiona'yı kurtarma görevi sırasında ona aşık olur ve prensesin de sakladığı bir sır vardır.

Shrek, birtakım maceraların ardından Prenses Fiona'yı kurtarmıştır ve ardından da evlenmişlerdir. Şimdi Shrek’in yapması gereken bir şey vardır. Shrek, Fiona’nın ailesiyle tanışmalıdır. Bunun içinde Fiona’nın ülkesine gitmelidirler. Bunun üzerine Shrek, Fiona ve Eşek yola çıkarlar. Yolculuğun sonunda ülkeye varırlar ama Fiona’nın ailesi şok olur ve kızlarının kurduğu hayattan pek de memnun değillerdir. Shrek'in kaba ve çirkin görünüşü, krallığı için endişelenen Kral Harold'u tedirgin eder. Evlilikleri sarsan bir gerilim ortaya çıkar. Sonuç olarak bu yolculuk ailenin beklediği gibi mutlu bir şekilde başlamaz.

Kral Harold ölmüştür ve tahtın yeni bir krala ihtiyacı vardır. Varis olan kişi de beceriksiz dev Şrek'tir. Ancak bu kral olma fikri Şrek'in hiç de hoşuna gitmemektedir. Onun en büyük isteği hamile eşi Fiona ile beraber bataklıktaki sevgi dolu evlerinde huzurla yaşamaktır. Bunun için tahtın bir diğer varisi olan Artie'yi bulması ve tahta onun geçmesini sağlaması gerekmektedir. Artie'yi bulmak için yola düşen Şrek yanına arkadaşları Eşek ve Çizmeli Kedi'yi de alır. Bu esnada Yakışıklı Prens de kral olmaya çalışan kötü adamların arasına katılır.

Şrek artık mutlu mesut bir hayat sürmektedir. Yanında çok sevdiği karısı Fiona ve üç çocukları da vardır. Çocuklarına bir doğum günü partisi düzenlediklerinde Şrek bir sinir krizi geçirmesi sonucu fark eder ki Şrek eski yaşamına oldukça büyük bir özlem duymaktadır. Fiona'dan önceki hayatındaki gibi bir dev olmak istediğinde Rumpelstiltskin ile bir anlaşma yapmaya karar verir ancak Rumpelstiltskin bu anlaşmada hiç de dürüst davranmayacaktır. Çok fazla zaman geçmeden Şrek kendisine kurulan tuzağın farkına varır ve şimdi başına açtığı her şeyi düzeltmek zorundadır.